ｵｽｽﾒ武器:ﾊﾝﾄﾞｶﾞﾝ
瞬間移動しながら、３発１ｾｯﾄの手裏剣で攻撃してくる。
手裏剣を投げるときは動きが止まるので、その瞬間に攻撃をしよう。
また、こちらが近づくか遠ざかると行う瞬間移動は、『ﾊﾝﾄﾞｶﾞﾝ』がｷﾞﾘｷﾞﾘ当たる程度の間合いならば行わないようになる。
９発で撃破可能だ。
ランニングマン
必須武器:地雷
ひたすらｽﾈｰｸを追ってくるだけで、直接的な攻撃はしてこない。
ただ、対決場所がｶﾞｽ地帯なので、急いで倒さないとこちらのLIFEが尽きてしまう。
倒し方は簡単で、部屋の出入口に『地雷』を仕掛け、踏ませるだけ。
こちらを追う特性を利用して誘導すれば、６発で倒せる。
ハインドD
必須武器:ｽﾃｨﾝｶﾞｰﾐｻｲﾙ
『ｽﾃｨﾝｶﾞｰﾐｻｲﾙ』でしか撃破できず、４発当てることが必要。
最大の注意点は、『ｽﾃｨﾝｶﾞｰﾐｻｲﾙ』の装備中は移動できないこと。敵は機銃で攻撃してくるので、相手が接近したら装備を外して別画面へ逃亡。
遠ざかったら装備し直して、攻撃を再開しよう。
フォー・ホースメン
ｵｽｽﾒ武器:ｸﾞﾚﾈｰﾄﾞ
４人と同時に戦うことになり、天井と地面を行き来しながら銃で攻撃してくる。
どんな武器も効くが、ｵｽｽﾒは威力と範囲の大きい『ｸﾞﾚﾈｰﾄﾞ』。それぞれの撃破に６発ずつ必要となる。
なお、天井に逃げた敵は攻撃をしてこないが、こちらもﾀﾞﾒｰｼﾞを与えられない。
ナイト・フライト
ｵｽｽﾒ武器:ｸﾞﾚﾈｰﾄﾞ
敵は周囲の色と同化しているため、視認できない。
その状態からﾏｼﾝｶﾞﾝで攻撃してくるが、逆にそこから相手の位置をわり出して攻撃しよう。
すべての武器が効くが、『ｸﾞﾚﾈｰﾄﾞ』なら多少ｱﾊﾞｳﾄな狙いでも敵に命中するのでｵｽｽﾒ。
６発で撃破可能。
メタルギア改D
必須武器:ｸﾞﾚﾈｰﾄﾞ
『ｸﾞﾚﾈｰﾄﾞ』を脚部に当てないと、ﾀﾞﾒｰｼﾞを与えられない。狙いが甘いと胴体部に当たってしまうので注意。
12発当てないと倒せないので、十分な弾薬を用意してから挑もう。
敵の攻撃手段は、ﾏｼﾝｶﾞﾝとﾎｰﾐﾝｸﾞﾐｻｲﾙ。
ﾀﾃ移動で攻撃を回避しつつ、ｽｷを狙おう。
グレイ・フォックス
必須武器:格闘
ﾒﾀﾙｷﾞｱD撃破後の連戦となる。
その際、ｲﾍﾞﾝﾄで全ｱｲﾃﾑがなくなるので、格闘攻撃のみで戦うことになる。幸い、ｸﾞﾚｲ･ﾌｫｯｸｽも格闘による攻撃しかしてこないので、条件は同じだ。
また、戦闘前にはLIFEが全回復するので、不利なく戦える。
戦闘時の注意点は、周囲に多数の地雷が設置されていること。この戦闘中はﾎﾌｸできないので回収もできない。
うかつに動かず、初期位置で敵を待ち受けるのがｾｵﾘｰとなる。なお、敵は地雷にひっかからない。
倒し方は、相手の攻撃に合わせてｶｳﾝﾀｰで迎撃すればよい。撃破には24発が必要なので、気長に戦おう。
ビッグボス
必須武器:ﾗｲﾀｰ＋ｽﾌﾟﾚｰ
非常に特殊な戦いとなり、敵の攻撃をかいくぐりながら必要ｱｲﾃﾑを集めなければならない。触れると即死する硫酸もまかれていて、それを中和する『B1ﾚｰｼｮﾝ』が最低１つは必要だ(この戦闘中で入手可能)。
ﾋﾞｯｸﾞﾎﾞｽ撃破に必要となるのは、即席の火炎放射器となる『ﾗｲﾀｰ』と『ｽﾌﾟﾚｰ』。それらはﾛｯｸされた室内にあるのでｶｰﾄﾞを集めながらﾏｯﾌﾟ内を回ろう。
『ﾗｲﾀｰ』と『ｽﾌﾟﾚｰ』を同時に装備して火炎放射器を作り上げたら、いよいよ反撃開始。
障害物ごしでも攻撃できるので、苦戦はしないはず。12発で撃破可能だ。
